Запущен портал с тысячами моделей стволовых клеток

Институт Аллена по изучению клеток запустил проект, посвященный стволовым клеткам. Одной из его составляющих стала коллекция трехмерных изображений стволовых клеток. Эти модели ученые получили, использовав глубокое обучение и клеточные линии, измененные с помощью технологий CRISPR/Cas. Подробности можно узнать на сайте проекта.

Коллекцию, в которую входит более шести тысяч изображений индуцированных плюрипотентных стволовых клеток, можно будет использовать для предсказывания того, какая структура клеток может оказаться предвестником развития рака и других заболеваний. Ключевые компоненты клеток подсвечены флуоресцентными маркерами.

Подготовка проекта началась около года назад, когда группа ученых под руководством Рика Хорвица, главы Института Аллена, модифицировала стволовые клетки, в результате чего структуры клетки стали подсвечиваться. Тогда стало ясно, что, хотя все клетки генетически были идентичны материнской, расположение, форма и количество компонентов клетки в них различались. После этого на имеющихся изображениях методами глубокого обучения тренировали компьютерную программу. По информации о нескольких чертах (например, расположении ядра) система научилась предсказывать другие характеристики клетки. Это позволит определить, какие изменения произойдут в строении клетки, если убрать, например, ген, ответственный за развитие заболевания почек. В дальнейшем коллекция также пополнится изображениями стволовых клеток на разных этапах ее развития.