Федеральный научно-исследовательский центр «Кристаллография и фотоника» Российской академии наук (ФНИЦ «Кристаллография и фотоника» РАН) был создан в 2016 году путем присоединения к Институту кристаллографии имени А.В. Шубникова РАН Института проблем лазерных и информационных технологий РАН, Института систем обработки изображений РАН и Центра фотохимии РАН.
Институт кристаллографии имени А.В. Шубникова является частью Российской академии наук с 1943 года. Его основал советский кристаллограф, академик Алексей Шубников. Институт ведет научные исследования в направлении изучения структуры и свойств кристаллов. В учреждении действует пять учебно-научных центров.
Институт проблем лазерных и информационных технологий Российской академии наук (ИПЛИТ РАН) был создан как Научно-исследовательский центр по технологическим лазерам Академии наук СССР в 1979 году. Организационно ИПЛИТ РАН входит в состав Отделения нанотехнологий и информационных технологий РАН. Институт разрабатывает фундаментальные и прикладные проблемы создания лазерных и информационных технологий, является одним из ведущих институтов по разработке мощных технологических CO₂-лазеров. Учреждение расположено в городе Шатура Московской области, также в составе Института есть отделение перспективных лазерных технологий, расположенное в Троицке.
Институт систем обработки изображений РАН (ИСОИ РАН) был создан на базе Самарского государственного аэрокосмического университета имени С.П. Королева в середине 1970-х годов. Основным направлением деятельности института является решение фундаментальных задач компьютерной оптики, обработки и понимания изображений. В структуре ИСОИ РАН находится четыре лаборатории: лаборатория дифракционной оптики, лаборатория лазерных измерений, лаборатория математических методов обработки изображений и лаборатория микро- и нанотехнологий.
Центр фотохимии РАН был официально создан в 1996 году. Научное учреждение работает по следующим направлениям: научное и аналитическое приборостроение, светочувствительные материалы и среды, дисперсные среды и материалы на их основе, интернет-технологии и информационное обслуживание. На базе Центра работают кафедра физики супрамолекулярных систем и нанофотоники МФТИ и физики наноструктур и сверхпроводников НИЯУ МИФИ.
Исполняющим обязанности директора ФНИЦ «Кристаллография и фотоника» на данный момент является д.ф-м.н. Владимир Каневский.